In deze nieuwste game in de langlopende RPG-serie gaan spelers op een episch avontuur waarin een verhaal wordt verteld met “leven” als het centrale thema, terwijl de toekomsten van de twee voorgaande games in de Xenoblade Chronicles-hoofdreeks met elkaar worden verbonden.

Spelers kruipen in de huid van de hoofdpersonages Noah en Mio en bevinden zich te midden van een conflict tussen de naties Keves en Agnus. Zes personages uit deze twee naties bundelen hun krachten om de waarheid achter deze strijd aan het licht te brengen, en zetten hun zinnen op Swordmarch, een land dat door een gigantisch zwaard wordt gespleten.